一路败亡的大顺军经过湖北九宫山，亲自率领部下探路的李自成竟被当地农民武装杀害。不过，人们似乎不太愿意相信这个结果，东征西讨十多年的闯王随随便便就被几个农民杀害，好像有点太戏剧性了。所以，此后有关李自成的真正去向也成为了谜团。
有人说在战败后，李自成难以接受大起大落自缢而亡，但可能性并不大；在一本叫做《荒书》的古籍中写到，李自成同一位叫做程九伯的人搏斗，惨遭他人偷袭而亡；甚至还有说法，称闯王在兵败后再次出家为僧躲避追杀或是回到自己老家归隐起来了。总得来说，李自成的失败还是可以预料到的，自身阶级的局限性就已经注定失败，这一点同样也是其他朝代农民起义军所存在的问题。
