次年，清朝签订了《辛丑条约》，慈禧太后回到紫禁城，由于张镇芳忠心可鉴，被提拔到四品。1902年，李鸿章因病去世，袁世凯被提拔为直隶总督兼任北洋大臣，因为裙带关系，张镇芳的仕途越走越顺。
1907年，袁世凯被弹劾，军权被夺，张镇芳暂代直隶总督职务。在袁世凯活跃时，张镇芳的官坐得就比较稳，在袁世凯去世后，张镇芳只能转向支持张勋逆势复辟，结果被判处无期徒刑，逮捕入狱。
后来经过众人说情加上疏通关系，以病情严重为理由，被遣送到天津，坐牢三个月后释放。张镇芳后来没有再参与政治，而是担任银行董事长。
1933年，张镇芳去世，死后被埋葬在天津南郊的一个村落里。
两江总督张勋
