在今的广东梅县，还流传着一个传说：相传，北京城沦陷之后，生死不明的明太子朱慈烺实际上是与当时的翰林院编修李七淳偷偷潜回了梅县，他们在这里削发为僧，悄悄地活了下来。在阴那半山人烟荒芜之处，建立了一座"紫殿"，最终，老死于深山之中。
楚藩的分支祁阳王一脉，楚藩沦陷之后，他们先是逃到了福建，福建也沦陷之后，他们便与一个名为严炜的书生一起更改了姓名，并入瑶族之中以求自保。所以，在现在的瑶族之中，应该也有明朝皇族的血统。
当然，也有一部分明朝宗室人员，被迫接受满族统治，投降清朝以求能让家族延续下去。
战争前期，向清王朝献上忠心的有潞王朱常淓，第二年被清廷杀害于北京，后裔下落不明。后期投降的即为逃到台湾的那一批，国姓爷郑成功赶走荷兰人以后，以台湾为根据地进行反清复明活动，优待当时前来投奔的明朝宗室人员。
