三、淝水之战的胜利，为东晋北伐中原， "兴复旧都"创造了条件。刘牢之和一些参战将领也乘胜利的余威在东起淮泗，西至荆襄的千里边线开始出击。尤其是刘牢之，一路领先，于第二年(384年)正月进克淮城(安徽亳县)，八月攻下彭城，九月又奉命攻取鄄城，河南城堡望风降附。385年初又渡河攻占黎阳(今河南浚阳东北)，并进军邺城，使后燕慕容垂北趋中山(河北定县)，以避晋军的兵锋。但东晋王室久居江南，已无收复北方进而统一全国的决心，牢之被借故召回，英雄无用武之地。连收复的地方也得而复失。
四、397--398年间，青兖两州刺史，掌领北府兵权，又是"国舅"的王恭，两次举兵讨伐在朝的王国宝、司马元显等人，同时联合殷仲堪、杨全期、桓玄等各方将领遥相呼应。刘牢之时任王恭的府司马，领彭城内史，加辅国将军，在王恭第二次举兵时他担任前锋，也就在这次起兵当中，他倒向朝廷，袭击王恭，使恭败死。
随即，桓玄、杨全期、殷仲堪等自动罢兵。刘牢之即以"都督兖、青、冀、业、并、徐、扬州、晋陵诸军事"，代替王恭，执掌北府兵权，达到权力高峰。他起自小将，一朝发迹，引起"众情不悦"，特别是杨全期、桓玄等还率兵逼近京师，"上表理王恭，求诛牢之"，牢之也不示弱，带北府之众，驰赴京师，到达新亭，因桓玄等受诏退去，刘牢之复又还镇京口。
五、和在其它战场上一样，刘牢之因"战无不捷"而成为镇压农民起义最凶狠的刽子手。东晋末年孙恩领导的农民起义，是对东南门阀士族地主势力的一次大清洗，很多士族地主为义军所杀。如王凝之全家，谢邈、谢冲一门，孔道、孔福兄弟等。甚至在肥水战中巧施计策的卫将军谢琰也因骄横"不为武备"连同其子都成为义军的刀下鬼。起义军的所向克捷引起东晋朝廷的恐惧。执政的司马道子无他谋略，"唯日祷蒋侯庙"。司马元显则每战"频不利"。独刘牢之"屡胜，杀伤其众"，因而进拜前将军，都督五郡诸军事，他或自己出马，或遣部下刘裕及其子刘敬宣征讨，屡屡"大破之"，孙恩沉海死后，他更是"威名转振"！
