相比于尚书台，东吴的御史台比较完备，御史台的最高长官是御史大夫，下有御史中丞，刘璋的儿子刘阐就当过东吴的御史中丞。御史中丞以下还有御史中执法，专门负责京师的官场都察工作。东吴的御史监察部门还设有专门的对口监察职务，有专门监督军粮的御史，有专门监督农业生产的御史。在东吴的监察系统中，还有一个比较特别的监察职务，就是"察战"。察战相当于朝廷派到地方上监察日常政务的巡视员，同时肩负体访下情的任务，官员百姓，都在察战的监督范围之内。
东吴的地方行政编制比蜀汉略复杂一些，东吴有三个大州：扬州、荆州、交州，后从交州中析置出广州。东吴州的最高长官是州牧或刺史，但有一点奇怪的是，在东吴建立以后，在现有史料中很难发现有别驾、治中、主簿这样的高级辅官。
在郡一级的编制中，东吴还有一个特殊情况：不是所有的郡一级区划都称为"郡"。在扬州的区划编制中，曾经设立过"典农校尉"，典农校尉是郡级待遇，而且单独治理一个郡级区划，比如现在江苏的镇江、常州、无锡，当时就是东吴的毗陵典农校尉辖地。
东吴的县和郡一样，有些县不设县令或县长，而设部校尉，比如会稽郡的长山（今浙江金华）西部都尉、桂阳郡的始安（今广东韶关）南部都尉等，但数量不多。
怎么说呢，东吴的官制在当时的世界显得格格不入，可能是因为不像魏蜀为了宣传自己是继承汉室吧。
