洪武元年(1368)四月，朱元璋巡幸汴梁，御史中丞刘基和左丞相李善长留守应天。
刘基认为宋、元因宽纵失天下，现在应该严肃纲纪。中书省都事李彬贪赃枉法，罪当处斩。李善长与李彬私交深厚，请求从轻发落。
刘基没有理会李善长，向朱元璋请示后，处死了李彬。行刑时，官府正组织人求雨。
朱元璋回来后，心怀嫉恨的李善长弹劾刘基在神坛下杀人属不大敬，一些怨恨刘基的人也趁机诬陷他，朱元璋大怒。刘基请辞，回归故里。朱、刘之间开始出现裂痕。
刘基去官后，他的好友杨宪继任御史中丞。杨宪指示检校凌等轮流向朱元璋密奏李善长的缺点。
