至于胡惟庸是否谋反，历史上疑窦丛生，很多人持怀疑态度，《明史》中说："惟庸既死，其反状犹未尽露。"甚至有学者认为，这是朱元璋自导自演的一场杀戮大戏，其目的就是用正当名义剥夺胡惟庸手中的相权。
胡惟庸死后，明太祖朱元璋下令废除丞相制度，再不设中书省，从历史的结果来看，这场跨度十二年之久的谋反案，连坐三万余人，受株连至死或已死而褫夺爵位的开国功臣有李善长、南雄侯赵庸、荥阳侯郑遇春、永嘉侯朱亮祖、靖宁侯等一公二十一侯，淮西功臣集团被诛杀者大半。
洪武二十六年，朱元璋再次补刀，凉国公蓝玉被锦衣卫告发"谋反"，被处死者达万余人，淮西功臣集团至此覆灭。
朱元璋与渐行渐远的淮西功臣之间的矛盾
纵观历史，淮西功臣从蒙元起义时的草根农民，到开国时的显赫贵人，再到朱元璋称帝时的刀下鬼，不得不感叹，命运的反复无常，同时与朱元璋的关系上，这简直是一出"兔死狗烹"的悲情历史剧，然而，从客观角度来讲，淮西集团的覆灭，除朱元璋爱猜忌的性格作祟外，还与淮西派自身少不了关系。
