就连明朝建立的最牛的两大功臣刘伯温和徐达也在劫难逃。有着明朝第一谋士之称的刘伯温在生病时，朱元璋指使胡惟庸送去下了毒的御药，结果刘伯温服用后很快一命鸣呼。而关于徐达的死，根据王文龙《龙兴慈记》载，徐达患有背疽，也就是后背有了毒疮，不能吃蒸鹅，但是朱元璋却赏赐给了他一只烧鹅，最后徐达哭着吃下蒸鹅，吃后就去世了。
除了赤裸裸地屠杀，朱元璋还大兴文字狱。
公元1397年，科举后发榜，取录宋琮等51名，是为春榜。因为录取的人都是南方人，因此被称为"南榜"。于是北方考生联名上书告考官刘三吾﹑白蹈信偏私南方人。于是朱元璋派遣12人去调查，结果没有任何问题，这是南方的文化水平远超北方的结果。然而，朱元璋却为了平复北方考生的怨气，竟然将刘三吾﹑白信蹈等考官列为"蓝玉余党"，加以打击，这就是历史上著名的"南北榜案"。
