窝阔台厌恶长子贵由，然而对贵由的母亲，也就是乃马真皇后却始终如一。
在窝阔台执政后期，军政大事基本都由乃马真皇后一人包揽，窝阔台本人则日夜坐在军帐之中，与各路近臣以及宠妃饮酒作乐。而乃马真也在执政期间显露了自己出众的政治智慧以及才华，并吸纳了一批蒙古贵族为他所用。
窝阔台死后，耶律楚材决定依据口谕立失烈门为新任蒙古大汗，然而此事遭到了乃马真皇后为首的蒙古贵族的反对，乃马真执意要让贵由继任大汗，双方日夜争吵，汗位继承一事陷入僵局。
为了避免蒙古因汗位继承纠纷而爆发内乱，乃马真和耶律楚材各让一步，耶律楚材不再执意要让失烈门继位，而乃马真皇后也表示她将暂时摄政，等到失烈门有能力担任大汗的时候再让其登基。而耶律楚材也因此被蒙古宗室所排挤，被迫告老称病，不再过问政务。
