随后得孙嘉淦又重新被雍正启用，升任刑部尚书，在位期间也是明察秋毫不放过一个坏人也不冤枉一个好人。后乾隆元年（公元1736年）雍正帝去世，乾隆帝上位。孙嘉淦上奏《三习一必疏》。
大意即使劝解君王莫要偏听偏信，自以为是。处事一定要讲究证据。不然只要作为帝王，所有人都一定会顺从的，若是自以为是也没有人会敢于告诉他做错了。乾隆帝虚心纳谏，此疏一直流传到后世。
到了乾隆十二年（公元1747年），孙嘉淦决定告老还乡，乾隆应允。可是孙嘉淦一生为官清廉，可以说是两袖清风。除了君主赏赐得东西并未有其他财物，就此回乡未免太过寒酸，乡亲们也会笑话。于是决定在车上放上几口木箱，里面装上砖头，假装是自己很有钱，衣锦还乡。
随后有人向乾隆上书，称孙嘉淦回乡带上了大几口木箱回乡，很是有分量。里面装的一定是金银之物，但是孙嘉淦自称两袖清风。乾隆大怒派人前往拦截孙嘉淦，检查木箱。孙嘉淦羞郝得解释原因惹得乾隆帝大为感动。
随即就让孙嘉淦行路途中得官府将其木箱得砖头换成真金白银，使其衣锦还乡。可是两年时候，乾隆还是召孙嘉淦回京，入尚书房议事。乾隆十五年（1750年）再次入朝，担任兵部侍郎一职位，后又升任尚书一职并署理翰林院掌院学士。乾隆十八年(公元1753年），孙嘉淦去世，享年71岁，死后追谥"文定"。朝中众人都羡慕不已。
