收复失地后，福康安率领汉、满、藏共六千清军剩胜追击直指廓尔喀京城阳布(即加德满都)，廓尔喀军队最后一役功亏一篑。最后廓尔喀统治者不得不求和，为表诚意，不仅送还了掠走的乾隆帝赐给六世班禅的金册，还派重臣携带驯象、孔雀和乐工13人前往北京朝贡，从此尼泊尔成为了清朝的藩属国。
沙阿王朝和清廷建立藩属关系后，对大清帝国忠心耿耿，前后两次要派兵援助中国。鸦片战争爆发后，世界列强着手瓜分中国，尼泊尔国王得知后，上书清廷驻西藏大臣提出派兵帮助中国赶走侵略者。可惜当时这位大臣太未将此情况上奏中国皇帝。平天国起义运动爆发，尼泊尔国王又上书清廷要求出兵携带大炮到中国内地助剿，当时大清非常自满，于是婉拒。
涣散的清朝
1911年，中国辛亥革命爆发，清王朝覆灭，袁世凯称帝。当时袁世凯邀请尼泊尔并入中国，但因尼泊尔已为英印所控制，同时当初效忠的大清国皇帝也已经退位了，所以国王没答应，至此脱离中国。
独立后的尼泊尔是中国的友好邻邦（处在同位置的不丹曾也是中国的藩属国）,沙阿国王后裔至今中国保持着密切的联系。由于地理位置原因，尼泊尔也或多或少受另一个邻国印度的影响，印度一度牵制尼泊尔。但是，尼泊尔不是不丹（曾经的中国藩属国）。
