相比较于建文帝身边缺少优秀的指挥官，他们都在朱元璋的打压下去世，朱棣身边的指挥官都是亲身在边地战争鬼门关走过一遭的人。而且，建文帝的皇宫内，太监们又积极的帮助朱棣刺探情报。战争最后以朱棣的胜利告终。建文帝最终不知去向，消失于茫茫人海。
不过，战争的胜利并不意味着朱棣可以高枕无忧。事实上，朱允炆虽然不是一个擅长军事的皇帝，却得到了许多儒生文人的支持。他性格温和，即位不久，便革除了祖父留下的许多弊政，儒生都视他为理想的君王。他们将以儒家的理想国为标准，创建一个新的太平盛世。消失的朱允炆，如同未曾离开的幽灵，随时扎在朱棣心间。许多人仍在支持他。毕竟无论朱棣是以怎样的名义起兵，从法理的继承顺序来讲，朱允炆比朱棣更具合法性。
所以，靖难之役后的朱棣，首先要解决的问题，就是证明自己的合法性。过去一个君王的合法性，主要来源于几个方面。一个是天下臣民是否拥戴，这关乎到人心的去向。一个是帝王们努力证明的天命问题，这可以为他们披上一层神圣的外纱。一个是祖先的继承，在皇位是以血脉来考虑的时候，这一点极为重要。
