不过由于元军派系间的内斗，驻军关中的王保保与李思齐、张良弼等人同为名将，却无法合作，单打独斗难以深入中原，也就无力解大都之危。
拿下大都，徐达再调转头来，兵发西北，与元朝关中军团决战，等到李思齐、张良弼等人被各个击破，王保保反而得到了好处，他得以收容他们的残部，实力比原先壮大起来。
此时，北元也不断反扑，数次出兵南下，差点乘虚攻占北平，为了解除威胁，朱元璋不得不继续一次次发动北伐，徐达、李文忠并在洪武三年于应昌将王保保打得大败，逃奔和林。
但在1370年元顺帝病死后，皇太子爱猷识理达腊即位，北元声势复振，大有卷土重来之势。
为啥呢，其实前面文章也讲了。因为这位后被尊为元昭宗的孛儿只斤，是位矢志中兴之主，不像他老子晚年那样混吃等死，他启用了王保保为丞相，朝政气象一新，明朝境内的元朝遗民闻风蠢蠢欲动，多地都出现了反叛。
