不爽归不爽，秦桧已然成了金国是南宋内部的化身，再借宋高宗三个胆子也不敢明目张胆地对秦桧动手，只能隐忍不发。另一边，秦桧继续炮制冤狱，担心身后名的他，还禁止私人修史，同时把亲信安排成史官，肆意篡改官方史料档案以文过饰非。
如果秦桧活得够长，估计还能看到一场他跟宋高宗的权谋对决，然而秦桧那点寿数跟宋高宗比起来还是差远了，尤其是秦桧比宋高宗大了17岁，秦桧死的时候，宋高宗正当壮年。经历了十几年的皇帝生涯，宋高宗的帝王权术已经炉火纯青，这一点，在秦桧临死前表现得最为明显。
秦桧于绍兴二十五年（1155年）去世，这一年秦桧如往常一样掀起几场文字狱，处理掉几批反对他的人，其中牵连最广的，就是赵令衿案。赵令衿看秦桧的《家庙记》，随口一说"君子之泽，五世而斩"，就被人告发下狱，至于罪名嘛，谋大逆，这种罪，自然不会只有一个人，于是一牵连，五十三人全部下狱。
人凑齐了，秦桧却不能签字了，《宋史》记载："狱成，而桧病不能书"。秦桧千方百计把政敌牵连进来，却不能签授文书置他们于死地，可见秦桧这是病得很重，按照他这个年纪，病死也不算意外。
