直隶总督，实际上是总督直隶地方军政的略称，其秩为正二品，加兵部尚书衔为从一品，综理军民要政。有考核直隶地方之官吏、将弁年绩、升迁降贬之专责，有办理对外交涉事务之权。总督辖有直属部队，叫"督标"。还节制着该地方巡抚、提督、总兵的直属部队。
清晚期，所有的总督，皆兼授总理各国事务的衙门大臣衔。如光绪年间，直隶总督兼授北洋通商大臣。自清康熙起，近250年来，保定一直是直隶省的府治。保定的直隶总督署，是中国唯一一所保存完整的总督衙署。
从以上九门提督和直隶总督的职权来看，虽然都管着京城或京畿直隶，或许因历朝的官秩变动，九门提督和直隶总督，官秩相差不大，但权力职责却相差老远了。直隶总督因掌管京畿地方的特殊性，向来为"天下第一督抚"。
另外，从两者之管控的地域，也可以看出，九门提督只管个京城，直隶总督管京城所在的地区，范围相当于北京、天津两城，河北省大部分和河南、山东的小部分地区。
