而萨尔浒之战，明军出征主力是以边军精锐为主：当时明军总数约八万六千人，与盟友海西女真叶赫部军一万人，朝鲜军一万三千人，总计十一万多人，号称四十七万。明军共损失兵力约45800余人，战死将领300余人，丧失骡马28000余匹，损失枪炮火铳20000余支，元气大伤。
战败的消息传到京城，万历皇帝震惊不已，朝廷谏官纷纷上奏弹劾萨尔浒之战明军总指挥杨镐，皇帝将其下狱后，随即判处死罪。公元1629年（崇祯二年），明朝在后金军事打击下开始越加内外交困，崇祯帝为挽回人心，下令将杨镐执行死刑。
因此萨尔浒之战的惨败标志着在明朝边疆军事力量已经成建制消失，在辽东军事存在的真空也让大明失去了屏障，后金可以长驱直入，但内地却无力派出军队去填补这块巨大的军事真空，萨尔浒之战才成为大明由盛至衰的分水岭。
因此萨尔浒之战后，努尔哈赤一路追击，又发动了开铁之战，败军在归拢前就被彻底消灭，关内援军又迟迟无法到达，新任辽东经略熊廷弼到任时，辽东在册之兵只三万三千人，堪战着不足万人，辽东的军事体系可以说是被彻底摧毁了。
