表面上看来，嘉靖做出了让步，实则迈出了更大的步子：嘉靖三年（1524），桂萼上疏请改称孝宗为皇伯考，兴献帝为皇考。二月，罢免杨廷和。三月，任命席书为吏部尚书。四月，追尊兴献帝为本生皇考恭穆献皇帝。五月，张璁、桂萼联名上疏，提出去掉"本生"二字。九月，嘉靖诏示天下，称孝宗为皇伯考，献皇帝为皇考。并将兴献帝的牌位升袝太庙，排序在武宗之上，改兴献王墓为显陵，大礼议事件至此以嘉靖帝的胜利最终结束。在这期间，反对嘉靖的人或下诏狱拷打，或摘官夺俸，或令其归家。
虽然嘉靖还很年轻，经过大礼仪事件，大臣们都见识到了这位少年皇帝的厉害，从此树立了至高无上的权威，嘉靖此后变得更加独断专行，刚愎自用。
