聂士成奉命渡海援台，与福建巡抚刘铭传共同反击法军。两人合作，将法军打处溃不成军。以致于法军不得不承认，这支清军队伍，让他们见识了中国军队的厉害。
1891年，热河金丹教叛乱。
聂士成奉命平定叛乱。他一举捣毁叛军根据地贝子府和下长皋，擒获叛军首领杨悦春等人。此次捷报传到清廷，慈禧大喜，赏赐黄马褂一件，并赏封号"巴图隆阿巴图鲁"的称号。
1894年，甲午战争爆发。
聂士成奉命随提督叶士超援朝。由于敌众我寡，再加上叶士超一心乞降，毫无斗志，平壤等地接连失陷。无奈之下，聂士成只得率兵坚守虎山，并利用山高路险、设疑疲敌等计谋，拖住敌人。随后，他以雪夜突袭的方式，接连夺取连山关和分水岭等地。他不光杀敌众多，还击毙了日本将领富刚三造。
