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外二十四军之外，杨广又将三台五省九寺朝臣和十二卫宿卫部队合编为天子六军，合计总共为三十军。
大军出发，未至辽东，两个月之内就先后挂了三个宰相级的重臣：先是內史元壽（元魏宗室，内史省长官），接着观王杨雄（杨隋宗室），第三个是兵部尚书左候卫大将军南苏道行军总管段文振。接着，三月，左屯卫大将军麦铁杖在渡辽水时战死（麦铁杖是麦姓始祖）。五月，纳言杨达死（门下省长官，杨隋宗室）。六月，来护尔、周法尚水师在平壤战败。
隋军虽然在涿郡囤积了大量的粮食，但是从涿郡往东，直到辽东却没有运河可供使用，其间还有沼泽湿地，可供大军通行的道路都不多，甚至连居民点也很少。在这种情况下，饶是涿郡有再多的粮食也无法提供前线百万军队之所需。所以为了减轻运粮压力，很多部队在到达辽东后就停下了。
等到隋军第一波主力赶到鸭绿江边，这支部队由9军组成，合计大约为三十万人--《资治通鉴》载：左翊衛大將軍宇文述出扶餘道，右翊衛大將軍于仲文出樂浪道，左驍衛大將軍荊元恆出遼東道，右翊衛將軍薛世雄出沃沮道，左屯衛將軍辛世雄出玄菟道，右禦衛將軍張瑾出襄平道，右武候將軍趙孝才出碣石道，涿郡太守檢校左武衛將軍崔弘昇出遂城道，檢校右禦衛虎賁郎將衛文昇出增地道，皆會於鴨綠水西。--事实上由于后勤的原因，这可能是隋朝能够投送到鸭绿江边的最大规模的部队了。而到达鸭绿江岸的部队，此时也面临着断粮的窘境。
