刘伯温一死，朱元璋和胡惟庸成了最大犯罪嫌疑人。
刘伯温临终前将儿子刘琏、刘璟唤来说："我观你们两个，都不是做谋臣将领的人，你们志不在此，而我又有这本《百战奇谋》，在我死后你们就将他烧掉，免得带来祸患。"
因此刘伯温的两个儿子并没有看过这本书，也没有子承父业，而他的两个儿子也都没有得到善终，长子刘琏生于1348年，1377年时和胡惟庸有意见冲突，被人迫害，最后坠井身亡；次子刘璟（字仲璟）生于1350年，因为明成祖朱棣篡位，他发誓一生不入朝为官，还要将朱棣篡位的过程全部写入史册，最后被抓入狱，在狱中自杀。
据统计刘伯温的后人在温州支系庞大，并向全国发展，最远的后裔在外国，共有6万多人，居住在温州的也已经有2万多了，子孙后代从事着各行各业。
每年祭祖活动，刘伯温的嫡系后裔都会从远方赶回来，大家热热闹闹欢聚一堂，每次都有500多桌的规模。
