在凤翔之战当中，作为李茂贞的拥护者，唐朝的宦官集团自然受到了最大的影响。刚一攻克凤翔，朱温就对宦官开始了大规模清洗，"时凤翔所诛宦官已七十二人，朱全忠又密令京兆搜捕致仕不从行者，诛九十人"。
除了屠杀京城当中的宦官，朱温连藩镇势力当中的宦官也没放过，只有当时尚还与朱温呈敌对态势的李克用、刘仁恭等人包庇隐藏了一些。剩下的宦官即便没有被杀，也都交出权力、与平民无异，而困扰了唐朝百余年的宦官干政也就此正式解决。
在朱温还未发动凤翔之战前，唐朝中央政府就已经处于任人摆布的状态。由于李茂贞距长安较近，这使他在染指朝廷事务上相比其他节度使来说有着天生的优势。唐昭宗对此感到忍无可忍，便招募军队讨伐李茂贞，结果落得个惨败的下场，无奈只能听命于他。
之后虽然唐昭宗仍心有不甘、试图反抗，但无一都遭到失败。而当凤翔之战结束后，面对一个比李茂贞的势力更加强盛的朱温，唐昭宗再也回天无力，表示出听之任之的态度。
