时人都认为李鸿章把年轻女儿嫁给张佩纶是政治婚姻，认为张佩纶攀龙附凤。但其实未必，张佩纶曾在写给友人的信中说"不婚犹可望合肥援手，今在避亲之列，则合肥之路断矣"！意思是本来不娶李菊藕还可以指望李鸿章在仕途上帮他，现在娶了之后，为了避免任人唯亲的嫌疑，李鸿章已经不能帮他了。可见这段婚姻只是披着政治的外衣，实际两人互有情意。婚后两人确实也琴瑟和鸣，夫唱妇随。
两人生下一儿一女。只是张佩纶晚年官场失意，经常郁郁寡欢，据说还影响到李菊藕的性格，让她也变得孤僻起来，可见保持乐观的心态有多重要！1902年，张佩纶病逝于南京。留下李菊藕和两个孩子。儿子7岁叫张志沂，女儿2岁叫张茂渊。
据说李菊藕对儿女管教甚严，整天在家闭门教孩子读书，孩子如果不好好读书，就经常对孩子进行体罚和棍棒教育。把全部心力放在教育儿女的事情上，本来这样也不错。可惜李菊藕享寿不长，1912年，李菊藕因为肺病在上海逝世。
