而这更让人感到奇怪，因为两江地区（江苏、安徽、江西）在曾国藩的治理下，按理说是没有什么匪患的；而更奇怪的是，朝廷竟然同意了。很明显，马新贻调任两江总督，是带着密令去的，目标很明确，那就是调查曾国藩，或者说是针对湘军。但在这期间，安庆发生了一起针对洋人传教士的事件，这就是"安庆教案"，并因此签订了《南京条约》。
在"安庆教案"后，马新贻去官署西侧箭道校阅士兵操练射箭，结束后步行回官署。刚走到门口，有一个叫张汶祥的人从旁边突然冲出来，伪装成想要告状的样子，近身后突然抽出刀来刺向马新贻，刺中了马新贻腋下，次日，马新贻因伤重不治身亡。护督将军魁玉将此事上报朝廷，朝廷惊愕悲悼，赐恤，赠太子太保，给予骑都尉兼云骑尉世职，谥端愍。
表面上看，这起刺杀案件，并没有什么奇怪之处，主犯也被抓了，给他定罪然后判刑就了结了。如果这仅仅是一起普通的刺杀案件的话，这么理解没错，但被杀的是身负密令的两江总督，而张汶祥仅是一个无名小卒，与堂堂封疆大吏似乎没什么关联，而且想要刺杀封疆大吏有这么容易的话，那曾国藩早死了一万次了，因为恨曾国藩的人绝对不少。
封疆大吏出行，身边明处的侍卫和暗处的保镖绝对不少，一般的人想见到封疆大吏都难，更别说刺杀了；但张汶祥就是这么轻松的成功了，而且他在刺杀马新贻后，既没自尽，也没有逃跑，反而是大声高呼："刺客是我张汶祥！"，并束手就擒，这明显就不像是有深仇大恨或者是职业刺客的行径，反而像是被迫来当刺客的。
