虽然朱祁镇请回来了，但朝中大权都在朱祁钰手里，因此只能老老实实做一个被软禁的太上皇。虽然朱祁钰这事干的不地道，但朱祁钰在治国方面确实干的不错。在位期间重用于谦等人，富国强兵，使明朝一度出现中兴的态势，被认为是不可多得的英主。但朱祁钰当皇帝很突然，不当皇帝也很突然。在他执政八年以后，朱祁钰突然重病，甚至一度不能上朝。朝中众多大臣纷纷讨论下一任皇帝该谁来做，有说朱祁镇的，有说朱祁镇他儿子的，有说朱祁钰他儿子的，谁也不能说服谁。
相较于这些只会打嘴炮的理论派，石亨等人开始联络宫门守卫和太上皇朱祁镇，准备来一次宫廷政变。在种种因素的作用下，这次政变还是很成功的，朱祁镇重登大宝，第二次做了皇帝。在他登基后一个多月，朱祁钰就在后宫去世，死因未知。而在朱祁钰死后，朱祁镇下诏谥他为"戾"，以亲王礼藏于北京西山，不允许葬入皇陵，将自己被囚禁七年的怨恨好好发泄了一通。
在朱祁镇去世后，他的儿子对于这位叔叔的功绩还是比较认可，于是下诏将其陵寝规模增加到帝级，并为他修改谥号。但级别与其他皇帝相比还是不如。直到南明时期，朱祁钰的地位才被提升到与其他皇帝相当的地步。作为一代明君，死后却如此凄凉，因此许多人都为朱祁钰感到痛惜。不过好在朱祁镇登记后痛改前非，将大明朝治理的也算不错，没白费朱祁钰在位时的一番苦心。
