前方的战事接连不断，命将四征、百万供给等，都是由李善长进行转调至正二十七年，朱元章册封李善长为宣国公。朱元璋改制之后，以左为上，朱元璋便封李善长为左相国，可谓是一人之下，万人之上。洪武元年一月四日，朱元璋在南京称帝，李善长被册封为左丞相，兼太子少师，并授银青荣禄大夫，管理军国重事。他的官制、礼仪等都与旁人不同，同时，李善长还监修《元史》，编撰了《祖训录》、《大明集礼》等书。
上至封建诸王，下到爵赏功臣，朱元章都要委托李善长和诸儒臣进行商议之后再执行。洪武三年，朱元璋对开国功臣行册封大礼，授予李善长开国辅运推诚守正文臣、特进光禄大夫、左柱国、太师、中书左丞相的崇高荣耀；册封韩国公允许子孙世袭；授予铁券，同时免李善长二死，李善长的儿子免一死。当时被封为公者一共有六个人，李善长位列第一，朱元璋下达的诏书中将他与萧何作比较，言辞中对他褒奖有加。
