于是，朱文正的不满终于爆发了，在他看来，洪都保卫战自己功劳最大，论功行赏却没有自己的份，于是整日里借酒消愁，甚至公然抢掠民女、买官赚钱，甚至在心态最失衡时毅然选择投靠张士诚，想要抗衡叔叔朱元璋。于是就有了文章开头的那一说，朱元璋得到密报，亲侄子朱文正准备倒戈、讨伐自己，愤怒难当。
为了当面向他悉心教导、寄以厚望的朱文正问清楚他究竟想干什么，朱元璋在刘伯温、宋濂的陪同下在进攻张士诚前夕马不停蹄亲自去了一趟洪都。而这次两人的见面很有戏剧性，看到叔叔朱元璋时，朱文正懵了，可朱元璋却一点也不懵，他连场面话都懒得讲，直接用鞭子去抽侄子朱文正，一边打一边质问：小子，你想干什么？
此事换作别人，朱元璋绝对是手起刀落，但朱文正不同，他是自己的亲侄子，也是最亲近的义子，同时还是洪都保卫战的第一功臣，再加上马皇后的劝阻，他没有杀掉朱文正，而是将他剥夺兵权关押在桐城，并将朱文正身边的将领以"不谏阻"之罪统统处死，就这样，朱文正这个天才将领最后在囚禁中死去。但朱元璋对这个侄子是不错的，甚至于还在洪武三年也即1370年封朱文正年仅八岁的儿子为王，就藩桂林，这既是对朱文正昔日功劳的封赏，也是对黄泉下父母、兄长的一个交代。
总结来说，朱文正的悲剧毫无疑问是源自他的性格，所谓性格决定命运，他不懂为人处世，不懂感恩谦让，而且性格乖张，心胸狭窄，品行不佳，就算他不坏在这件事上，总有一天也会因其他事而惹祸。而对于朱元璋来说，他一生铁血残酷、心狠手辣，却唯独对亲情难以割舍，哪怕最亲近、信任、看重的侄子朱文正背叛了自己，伤害了自己的感情，辜负了自己的养育，他终究没能痛下杀手，从这方面看，人的两面性展露无遗，即便是朱元璋这样的帝王也逃不脱这个桎梏。
