不久，解放战争胜利，新中国成立。肖万世退役后，去到四川大凉山雷波县的粮食站工作。肖万世担任雷波县粮食站站长时，粮食站的一名工人在粮库偷粮食，当场被发现。
肖万世问清事由后，了解到工人是因太过饥饿才偷的粮，且家中靠他一人养活。他感到很心酸，不顾粮食站的工作人员反对，坚持不追究工人过错。因为此事，肖万世被人告发，肖万世因“渎职”而受到了上级的重重处分。
肖万世一生中的三次处分均错不在他，但他对于组织的处罚从未有过怨恨，一直忠诚地为国家服务。
肖万世从战场退下后便默默无闻地在四川大凉山的小县城当一名粮食局工人，鲜少提及自己过去那辉煌的从军生涯。
肖万世的子女称，父亲很少在他们面前提到他的过去，有关父亲当兵时发生的事都是从父亲的战友那听来的。肖万世因作战英勇有谋，获得过多枚勋章。
肖万世的妻子把勋章装在一个布袋里。肖万世的次子肖亚林说：“父亲的各种勋章有五六十枚，母亲把它们收在一个布袋子里。小时候我们经常把它们拿出来戴着拍照。”
尽管见过肖万世的勋章，肖万世的子女也并不知晓这些勋章意味着什么，他们知道的只是父亲曾经当过兵，打过日本人。
与肖万世一同工作过的四川凉山州纪委副书记赵学斌称，如果不是肖万世过世，他也不知道肖万世竟立下如此多战功。肖万世虽与赵学斌共事过很长一段时间，但也未曾提起过他的过去。
