他让朱允炆在他死后七天就出殡，不用等其他在外就番的诸王。当时由于时间很短，朱元璋的其他儿子都在外地就番，根本来不及回京祭拜。而且在送葬的当天，南京城的十三个城门都有出殡的仪仗队，阵容也是完全相同，让人难分真伪，世人和众大臣也都不知道究竟那一支队伍才是朱元璋真正的送葬队伍，让人也不清楚朱元璋究竟葬在了哪里。
对于朱元璋的埋葬之地，世人提出了猜测：朱元璋没有葬在明孝陵地宫里，而是葬在了南京的朝天宫，也就是南京的万岁山，玄武湖附近也是重点怀疑位置，更是有人说朱元璋是魂归故里了。朱元璋这位伟大的布衣皇帝真正的埋葬地至今无人能够确定，他临死时还给世人设计了这么一个重大的阴谋，数百年过去了，至今无人能够破解这个秘密，这或许就是朱元璋的聪明之处吧，避免了陵墓被盗，在另一个世界得到了安宁的生活。
