药物研发
蛋白质结构对药物靶点的识别和开发至关重要。AlphaFold及其相关技术已经成为药物研发中的重要工具，例如药物通常作用于特定的蛋白质靶点，了解蛋白质的三维结构有助于确定药物结合位点及其活性区域。AI生成的蛋白质结构预测极大加快了这一过程。
同时AI技术可以帮助识别小分子药物与蛋白质之间的潜在结合模式。这为结构导向药物设计（Structure-Based Drug Design, SBDD）提供了一个高效的研究路径，从而加速药物的筛选和优化。
在了解蛋白质之间的相互作用之后，可以帮助研究人员设计分子来干扰这些相互作用，尤其是在癌症等疾病中，AI提供的蛋白质结构数据大大推动了这种药物设计。
精准医学与个性化医疗
蛋白质结构预测在精准医学和个性化医疗中也有着非常重要的应用，特别是在与特定遗传变异和疾病相关的蛋白质研究中
我们知道，许多疾病其实是由基因突变引起的，这些突变可能导致蛋白质结构异常。通过AI预测受突变影响的蛋白质结构，可以更好地理解这些变异如何影响蛋白质的功能，从而帮助诊断和制定治疗方案。
于此同时，通过AI技术也可以帮助我们发现与疾病相关的蛋白质结构异常，从而用于疾病的早期检测和监控。
