当年发掘时，张居中要求所有东西都要采样回来，土样也不例外。他们采集了一些被火烧过后板结的红烧土块，放在办公室里。1991年春天的一天，湖南考古所副所长裴安平路过郑州，来看望张居中，闲聊中，张居中问起彭头山遗址的古稻是怎么发现的，那是裴安平主持的考古项目，刚刚公布了古稻的发现。裴安平说，陶片上就有稻壳和印痕啊。然后指了指地板上的红烧土说，这里面说不定就有。张居中拿起一块掰开，真的发现了一个稻壳的印痕。他们接着掰了一上午，找到了十几个稻壳印痕，后来经过检测，确认为水稻。
贾湖原本是以采集渔猎为生的社会，之所以开始栽培农作物、扩大食物来源，必然是发生了剧烈的环境变化。根据环境考古结果，距今8900年至8700年发生了强低温事件，生活在亚热带与暖温带气候过渡带的贾湖先民，在冬春季获取食物想必变得困难。紧接着，距今8700年至8500年的急剧持续升温，又为稻作农业的产生提供了有利条件，成为解决食物短缺问题的良机。
"那时候贾湖人以渔猎为主，但狩猎、捕捞、种植、养殖、采集五大门类都有了，餐桌还是挺丰富的，营养还可以。"张居中笑着说。根据对人体骨骸的测量，贾湖遗址男性平均身高171厘米，女性平均身高167厘米，比今天全国平均身高还高。
在生活中的一些方面，八九千年前的贾湖人与今人其实相差不大。除了同样吃大米、喝酒，他们也养猪和狗。贾湖的居住地和墓地里出土了11个埋狗坑，埋葬着狗的完整骨骸。这是人们对家养动物一种有意识的处理，说明狗并不作为食物，而是被驯化的伙伴。"狗活着时为主人看家护院，死了就埋在房子旁边或墓地里，继续为主人看家护院。"张居中说。
中国社科院考古所研究员、动物考古专家袁靖说，迄今为止，贾湖遗址出土的狗是中国最早的家畜。"最早把狼驯化为家犬之时，当时的人很可能是首先将其作为宠物来对待的，这毕竟是当时第一种与人亲近的动物，而且会对人摇尾巴、亲近人、舔人等行为，都会增加人对它的好感，希望随时在自己身边。"袁靖说，这种行为出自古人对于友情的认识，也进一步丰富了他们对于友情的认识。
关于水稻、狗、人体等方面的认识，都得益于科技考古的介入。张居中认为自己是当时很早认识到科技考古重要性的人之一，不过80年代发掘阶段，"脑子里这根弦还没绷紧"。发掘之后的研究中，他找到植物、动物、农业、矿物、古人类、年代学等相关自然科学领域的学者，分头研究那些沾着泥土的出土物，将沉默的古物转化成科学成果。
1987年第六次发掘结束后，整整十年，张居中投入研究和考古报告编写中。仅仅是将陶壶搞清楚就花了一年时间，像拼图一样拼合碎片，再对比分析年代顺序，排好序列，分型定式，分出早晚。龟甲碎片也用去了大半年，粘起了几十副龟壳。1999年，近180万字的《舞阳贾湖》考古报告终于出版，奠定了贾湖遗址在我国新石器时代研究中的地位。
2000年，完成考古报告两年后，张居中从河南考古所调入中国科学技术大学科技史与科技考古系任教。该系的目的就是培养懂传统考古的科技考古人才。次年，他第一次带研究生进行田野考古实习，选择的正是自己最熟悉的贾湖遗址。尘封14年后，贾湖遗址迎来第七次发掘，科技考古手段首次全方位介入。植物考古学家在现场进行浮选，将土样放在水箱中，炭化植物遗骸浮出水面，得到了大量植物遗骸，古人类专家则对人骨标本进行了现场鉴定。
从何处来，到何处去
贾湖人在贾湖村世世代代生活了1500年，直到一场洪水毁灭了家园。然后，贾湖人迁徙到哪儿去了？
贾湖文化之后进入仰韶时代，贾湖文化分布的地域内，出现了舞阳郭庄遗址、阿岗寺遗址等。张居中说，这些遗址上的新居民与贾湖先民虽有些相似之处，比如种水稻，以及建房屋、制陶器的方法，不过这些相似之处主要是共同地理环境造成的，很难证明有继承关系。
而贾湖文化与淮河中下游的大汶口文化之间却出现了更多相似之处，尤其在墓葬和葬俗方面。两者都有大量石器、骨器以及动物随葬，墓葬中都有龟甲，龟甲下都装着石子……而葬式、葬俗恰恰是维系一个人类共同体的文化内核。张居中由此提出一个推测：贾湖先民离开家园以后，其中一支沿淮河东下，迁徙到了同纬度的安徽、山东、江苏等地。
那么向西呢？南阳盆地直到秦岭东麓，也是贾湖文化的分布范围。贾湖村往西50公里处的方城大张庄遗址，有大量直接继承自贾湖文化的因素。此地正好穿过叶县--方城走廊，这是连接华北平原与南阳盆地的咽喉要道。当洪水泛滥，家园沦陷，另一支贾湖人或许就穿越过这条走廊，到同族群生活的他乡生息繁衍。
他们留在贾湖村的遗存埋藏得并不深，考古队挖了不到半米就发现了踪迹。八九千后的后人发现，贾湖先民是一群有着特殊生活方式的人。
考古学家俞伟超曾描述过，贾湖的陶器与黄河流域裴李岗文化相当接近，而龟甲占卜和獐牙随葬的习俗，则与年代稍晚的山东、苏北大汶口文化乃至安徽薛家岗文化接近；贾湖的稻作农业，在黄河流域其他地区都不存在，却与长江流域一致。这意味着，贾湖是一处独特的文化，包含着黄河中下游和长江流域两大片文化系统的若干因素。俞伟超由此认为，考古报告中提出"贾湖文化"的概念是非常正确的。
在黄河中游的嵩山周围地区，距今8200年至7000年新石器时代中期的考古学文化，被命名为裴李岗文化，以最早发现的河南新郑裴李岗遗址命名。那段时期的整个中国，也被笼统地归纳为裴李岗时代，其后便进入文明形成的仰韶时代。贾湖遗址与裴李岗文化有较长时间段的重合，刚发现时，被理所当然认定为裴李岗文化范畴。但随着一些独特文化现象的出现，张居中认为贾湖与裴李岗文化有较大差异，应该命名为贾湖文化。俞伟超同意此说。另一些学者则认为，贾湖遗址与裴李岗文化大同小异，可以称为裴李岗文化的"贾湖类型"。
贾湖遗址出土的骨镖（上图）、石饰（下图）。图/贾湖遗址办
在同一时间的其他地域，长江流域的上山文化、跨湖桥文化、彭头山文化、高庙文化，辽河流域的兴隆洼文化等考古学文化中，也出现了水稻、黍粟、祭祀等遗存，与贾湖有相似的发展高度。中国人民大学历史学院考古文博系教授韩建业认为，当时已经出现了较为先进的思想观念和知识，包括宇宙观、宗教观、伦理观、历史观，天文、数学、符号、音乐等知识。这些较为先进的思想观念和知识体系，以及较为复杂的社会形态，将中国文明起源提前到距今八千年以前，可以视为中国文明起源的第一阶段。
韩建业认为，贾湖文化最具冲击力的地方，就在于精神世界的世界观、伦理观和历史观。"那时天圆地方的世界观形成了，出现了与历法相关的规和矩，有占卜用的龟甲、石子、符号，已经开始敬天法祖、向天卜问。伦理观主要是指墓葬，八千多年前就有了非常好的竖穴土坑墓，这是一种入土为安的思想。墓葬排列整齐，一直延续几千年，中国的墓葬一直是这样，体现了典型的亲情伦理血缘关系。历史观指的是非常强大的祖先崇拜习俗，有的祖坟持续了几百年，当时全世界完全没有第二个例子。"
张居中今年已经69岁，对贾湖仍有很多疑问，他的团队正在研究贾湖绿松石来源等问题。1999年的考古报告中，张居中留下了一个遗憾，他分析了贾湖文化的去向，却没有解释其来源，因为他认真思索后，仍然没有理出头绪。20多年来，他没有放下这个问题，如今心里已经有一个轮廓。"有思路了，但还属于科学假说阶段，有点虚无缥缈。"他对《中国新闻周刊》说。
