窝阔台死后，他的儿子贵由继承了大汗的位置，成为新的蒙古帝国的统帅。但是，拔都不服这个大汗，他连推举贵由作为大汗的大会都没有参加，直接表达了自己的态度。拖雷系也不满，但是，只能将其埋在心底。在这个时期，拖雷系的人比较注重结交其他蒙古贵族，表现出了老好人的一面，赢得了很多人的认同，这也为以后拖雷系后代争夺蒙古大汗提供了群众基础。
在贵由成为大汗后，对于拔都的这种不合作的态度十分生气，于是，召集大军准备西征讨伐拔都。但是，贵由对外声称的却是西巡，因为，自己的身体不好，需要到西边凉爽的地区调养，只字不提征讨拔都的事情。拖雷系得知其中的原委后，连忙派人赶在贵由大汗出征的前，给拔都通知了这个至关重要的信息。
得知消息，拔都也不甘示弱，准备好部队，也以迎接贵由大汗的名义往东进军，准备大战一场。结果，贵由大汗在西征的途中竟突然死去了。有传闻说，这是拔都派人下毒杀死的，也有说是拔都暗杀的，说法不一，都没有可靠的证据。贵由大汗死去后，窝阔台系已经有了两任大汗，貌似接下来的大汗位置也是窝阔台系的。
但是，历史不会这简单，毕竟，贵由当大汗时间太短，很多反对他的声音还有不少，并没有培植出自己的势力，这也导致窝阔台系的整体实力并不强大。而在世的人中，术赤系的拔都是成吉思汗子孙里面年龄最长，实力最强的人，说话也很有分量。他喜欢拖雷系的人，所以，全力支持拖雷的后代蒙哥做蒙古大汗。
