此外，万历还十分关心百姓的生活。为了百姓的庄稼能有一个好收成，亲自跑了20多公里路去帮百姓求雨。这个时候的万历，在朝臣眼中，是一位典型的圣主明君。既然这样，那他为何突然就不上朝了呢？而且一罢就是28年！这其中的原因，一直到近代才搞清楚。当时朝中大臣都认为万历是沉浸于声色犬马中，因此消极怠政。面对朝臣误解，万历作了解释，称自己身体不适，步履维艰，形象不雅，以后恐不能履行朝会。但朝中大臣却不相信，认为这不过是万历的借口，甚至还有臣子明目张胆破口大骂。
这样一来，万历跟朝中大臣的关系彻底弄僵了。在明朝中后期，朝中文臣的权力是很大的，万历见解释无用，索性就懒得解释了，躲在深宫中，再也不去上朝了，免得见到他们心烦。既然如此，万历不上朝的原因，真的是身体不适吗？这道谜题，近代著名历史学者郭沫若为我们揭开了。1958年，他带着考古工作人员试验性的打开了万历皇帝的陵寝，发现了一个令人讶异的事实。
