尉迟恭排名靠前是因为他救驾有功。李世民在搞定李建成后，准备对李元吉下手。尉迟恭在射杀李元吉时，把李世民的马吓惊了，一路狂奔进小树林，李世民被树枝刮落下马。李元吉拿起弓弦想要勒死李世民，尉迟恭大声呵斥李元吉。李元吉上马逃到武德殿，尉迟恭穷追不舍，一箭把李元吉射死。《旧唐书·尉迟敬德传》记载：
太宗所乘马又逸于林下，横被所繣，坠不能兴。元吉遽来夺弓，垂欲相扼，敬德跃马叱之，于是步走，欲归武德殿，敬德奔逐射杀之。
尉迟敬德对李世民有救命之恩。论功行赏时，适当优先考虑也符合人之常情。另外，凌烟阁二十四功臣的顺序符合历朝历代封赏的传统，谋士的地位相对靠前一些。汉朝的萧何和张良，明朝的刘伯温和李善长等等，程咬金和秦琼属于武将，也没有尉迟恭那样的突出表现，排名自然相对靠后。
李世民有意压制秦琼
早在玄武门之变前，秦琼的爵位远远超过凌烟阁二十四功臣里大部分人。秦琼的武艺相当不错，人缘也非常好。李渊在位时，对秦琼不遗余力地提携。李渊为了表达对秦琼的厚爱，也或者有意拉拢秦琼，曾经赐给秦琼一对金瓶并写信说"朕肉可为卿用，当割以赐卿"。
意思是说，你想吃我的肉，我都会割给你。堂堂的高祖李渊把话说到这份上，可见他们的交情非同一般。假如玄武门之变中，秦琼再次受到极高的赏赐，李世民还能拿什么给他。
李世民为什么要夺皇位，李唐家的矛盾从何而来，就是因为李世民的功劳太大，已经封到秦王的位置了。
