控制了军权的郭子兴又一次重振旗鼓。除了对朱元璋感到忌惮之外，他对其也是猜疑的。因为他的能力实在是太强了，自己死后儿子们可能完全不是他的对手。但是，他不得不依靠朱元璋来为他打世界，在削弱朱元璋的兵权的同时，又将重要的任务委托给他。面对丈人的百般刁难，朱元璋的心里很不是一番滋味。
几年后，郭子兴因病去世了。其子郭天叙担任大元帅，张天佑成为右副帅，朱元璋是左副帅。职位仍旧在此二人之下，尽管这两个人的职位很高，但他们没有任何的将才，很快就在战斗中丧生。最后由于朱元璋在军队中的地位和威望，他得到了士兵的支持，并最终坐上了头把交椅。
朱元璋又一次成为了主帅，自然有些人会感到不高兴。郭子兴的三儿子郭天爵自以为是父亲的继任者，他想摆脱朱元璋并重新夺回军权。朱元璋发现后，以谋反的罪名将其处死。为了避免以后的麻烦，郭子兴的家人被全部处死，只留下了马皇后。
当许多人评价朱元璋时，他们认为这钟做法是在恩将仇报，但事实并非如此。他将军权交给了郭自兴，算是一个知恩图报的人了。可后来郭氏家族却对其产生了杀心，他也不得不选择这样的做法，他其实也是一个恩怨分明的人。在成为皇帝后，朱元璋将郭子兴的养女封为皇后，这也是一起出生入死的原配夫人了。然后朱元璋为郭子兴正名，为他建了一座寺庙。
种种举动表明：朱元璋的所作所为是完全正确的。毕竟身逢乱世，如果自己不杀人，别人就会杀了你，对敌人的心慈手软就是对自己的残忍。
