北宋建立后，冯瓒成为兵部郎中，他生得风神俊爽，有口才，谈论风生，深得宋太祖赏识。朝廷任命冯瓒为左谏议大夫，到舒州做知州。舒州水产资源非常丰富，居民采捕以自给，由来已久，防御使司超到任时，横征暴敛，致使民怨沸腾。冯瓒一到任，认为不应夺民之利，于是奏请朝廷豁免一定的赋税，舒人大悦。建隆四年（963年），冯瓒改任庐州（今安徽合肥）知州。
乾德三年（965年），冯瓒以本官充任枢密直学士。此时后蜀散兵亡命相聚为盗，蜀地混乱不安，朝廷命冯瓒出任梓州知州（今四川三台）。冯瓒到梓州走马上任没有几天，四川有个逃亡的军官名叫上官进的，率领3000 名逃兵，胁迫几万百姓，趁着夜色，浩浩荡荡进攻梓州城，城内异常慌乱。冯瓒曰："贼乘夜奄至，此乌合之众，以轛挺相击，必无固志，正可持重以镇之，待旦自溃矣。"当时城中仅有云骑兵300人，冯瓒亲自坐于城楼以鼓舞士气，并密令更夫提前打更，未午夜，已击五鼓，后蜀散兵以为天将明，于是撤走，冯瓒乘夜纵兵追击，生擒上官进，斩于市，招降千余人，梓州境内转危为安。
冯瓒的功劳引起了宰相赵普的嫉妒，赵普对赵匡胤说冯瓒有作奸犯科之事。赵匡胤急忙找冯瓒回京，并亲自审问。而赵普早在冯瓒任梓州知州的时候就派人秘密观察他的行动，搜集他的过失。当赵匡胤审问冯瓒的时候，赵普不失时机地献上搜集到的冯瓒作奸犯科的证据。冯瓒认罪。赵普又派亲信到潼关清查冯瓒的行装，发现内有金带珍玩，都已封好，原来打算送给开封尹赵光义幕僚刘轜，对于这件事，冯瓒也服罪。赵普力主处死冯瓒，太祖免其死罪，削官流放登州（今山东蓬莱）沙门岛。
冯瓒事件在朝中引起了热烈讨论，很多大臣都认为赵普心胸狭窄，下手太狠。仅仅因为赵匡胤夸赞冯瓒就引起赵普的嫉妒，策划一场冤狱，确实不应该。当时冯瓒的事件在其他大臣、武将身上似乎都发生过，他们带着金银玩好之物送给朝中大臣，贿赂赵光义的手下，进而能和赵广义说上话，其实还是在做政治投资，本无可厚非。只是赵普抓住冯瓒的一点短处就不放过，大做文章。在当时大宋初建的时候，正是明确法令，行刑严格的时候，如果让人抓住了小辫子，还是让宰相抓住了小辫子，那就难逃罪责了。
