当有蒙古军进攻时，马芳一改往日阵地防守的策略，而是派出精骑绕到敌后，断绝蒙古大军的粮草后路，不断袭扰他们的后方家眷，搞得前方蒙古军心神不宁，作战效果很快就显现了出来。
从此，明朝军队都纷纷效仿这一作战思路，特别是河北、山西一带的边防，屡试不爽，这也算是开了现代特种兵作战的先河。
如果说马芳作战不一般，那么，他在人情世故上就更不一般了。
在马芳担任参将时，熟悉他的士兵都知道他有一个特点，就是过年的时候从来不在家，都是在一线巡逻。大家肯定会认为，这是马芳关爱士兵、过年不忘战备的表现，但实际上，这也是马芳的苦衷。
原来，他的顶头上司是仇鸾，这个人最大的特点是不会打仗，最大的长处就是贪污受贿，每到逢年过节，仇鸾的手里就有一个名册，下级军官到他家拜访，来一个，他就在名册上画一个，如果不来，那年后这个官就当不成了。
