李世民一看机会难得，天上掉下一馅饼，赶紧收拾人马赶往庆州，谁知道才走到宁州，杨文干就被部下所杀。李世民离开长安后，李元吉赶紧四下活动，找到李渊最宠爱的嫔妃给李建成求情，还让封德彝在朝堂吹风让李建成的支持者站台表态，内外夹攻之下李渊主意变了，不仅没有追究李建成，而且还让李建成以太子身份再回长安留守，这事性质变成了李建成和李世民兄弟不能相容狗咬狗，两人各打五十大板，把李建成幕僚王珪和李世民幕僚杜淹流放了事。
说实话李渊处理方法的确无厘头，一场造反大案就这么不了了之了。其实李渊这么做也有自己不得已的苦衷。第一李渊错误高估了事态的严重性。以为杨文干造反只是引子，很快会有全国各地的李建成支持势力群起响应，打着清君侧的名义支持李建成上位，结果杨文干一死嘛事没有。李渊事后觉得自己有点大题小做，反应过激了一些，于是给李世民的承诺也就随风而逝了。
第二李建成造反证据不充分。虽然有告发的使者作证，可是杨文干死无对证，李建成只是让杨文干送几个人到京师，具体做什么谁都不知道，这事随李建成怎么说都可以。李建成作为太子留守京师可以全权处理军国大事，调几个兵充实长安的保卫力量理所当然，有啥大惊小怪的。你说我要造反，我还要说你诬告呢。
