阴皇后因为嫉妒而怀有越来越多的愤恨之心。邓绥受宠日盛，使得阴皇后担忧嫉妒，屡次想加害于她。邓绥处事更加小心谨慎。一次，邓绥生病，和帝体恤她，就特许她的家人人官探视。但邓绥却拒绝了。宫廷宴会的时候，其他后妃都装扮明丽，唯独邓绥打扮素淡。偶尔和阴皇后穿的衣服颜色相同，她必定重新换上不同颜色的衣服。皇子们在后宫内接连夭折，邓绥知道后，多次流泪叹息，并一再给和帝选进才人，好让皇家没有子嗣的忧虑······凡此种种，使得和帝更加觉得邓绥通晓大体，可爱可敬。
俗话说自作孽不可活。永元十四年(公元102年)，阴皇后的祖母向她献计，以巫蛊之道诅咒邓氏速死或使皇帝无子，以保全皇后之位，结果被告发。和帝大怒，废掉阴皇后。阴氏家族因此被下狱治罪，阴皇后的父亲自杀而死，兄弟等人有死在狱中的，有被免去官职流放的。当年冬天，邓绥被册立为皇后。邓绥一再推辞不受，和帝不准，她才正式接受皇后玺绶。
邓绥居皇后之位依然节俭务实。以往每逢国家大型节日或者岁末，各地及小国都争相贡献珍稀宝贝以示祝贺，邓绥不想让这种奢侈之风延续，建议贡品用纸墨代替。和帝按照惯例要对邓家兄弟封赐也被邓绥推辞掉。所以，邓家族人始终都没有获得很高的官职。
