那些签证过期或非法入境的人可能被无限期扣留，有时长达数年。像拉特纳亚克曾经那样提出庇护申请的移民尤其不受欢迎。
作为世界第三大经济体，日本只为不到1%的庇护申请者提供了安置，去年只有47人。
2019年，在日本移民拘留所有198人绝食后，人权组织呼吁禁止日本移民局任意拘留并进行相关法律改革。据日本难民律师网称，自1997年以来，已有 27名移民在拘留所死亡。
实际上，今年早些时候，是否公布拉特纳亚克案视频的决定，成为日本国会辩论的一大焦点。当时，日本议员们正在讨论修改移民法案，其中包括在外国人两次申请庇护失败后驱逐出境的条款。
这一修改的目的在于，减少日本移民拘留设施中的人数。根据日本入管局数据，日本拘留设施的移民人数在2020年已攀升至1054人。
但包括一组联合国专家在内的人权组织表示，该法案的部分内容可能违反国际人权标准。最终，法案被废除。
但日本富士新闻网（FNN）12月4日援引入管局官员称，在拒绝驱逐的非法移民中，约有三分之一有犯罪记录。在许多情况下，他们滥用难民申请程序。
这名官员称，大约有3100名没有居留身份但拒绝服从驱逐的外国人，其中994人被判定犯有毒品罪或盗窃罪。这些外国人中的许多人反复申请难民庇护身份，利用他们在申请过程中不能被驱逐出境以及申请次数没有上限的事实。
入管局因此计划在2022年再向国会提交一项法案，以修订《移民控制和难民确认法》，允许对第三次及以后的申请进行驱逐。
除了移民问题，日本另一研修生制度，也曾被人广为诟病。2017年，新华社记者曾赶赴广岛，实地调查了当地研修生的生活，低廉的薪水、高昂的房租、恶劣的居住条件、时常挨骂、孤独寂寞，研修生的生存状态令人触目惊心。
联合国人权组织曾多次对日本政府提出批评，日本媒体也多次曝光研修生受虐待的情形，甚至有劳工团体指责日本政府是变相推行一种奴隶劳动制度，但是这一问题一直得不到合理的解决。
