696年跟随武攸宜征讨契丹，回到洛阳不久，他听说自己的父亲陈元敬在家乡射洪遭到了县令段简的折辱，考虑到陈元敬年龄已经很大，所以陈子昂上疏请求罢职归侍，武则天准了陈子昂的请求，让其回家侍奉父亲，这一年是698年，陈子昂回到了射洪县。
回乡不久，陈元敬去世，而在陈子昂居丧期间，县令段简又对陈子昂出手，关于这段经历，《旧唐书》记载得比较简略，只有一句话："简乃因事收系狱中，忧愤而卒，时年四十余。"
并没有交代段简因何事将陈子昂下狱，不过同时期的卢藏用曾留下一篇《陈子昂别传》，其上交代段简贪婪残暴，听说了陈家家财万贯，动了心思，想占为己有，遂想办法罗织罪名要害陈子昂，陈子昂害怕，就让家人给段简送去20万，但段简还觉得不够，还是数次将陈子昂拉到县衙受审。
