明朝是一个非常奇葩的王朝，分封制已经没落了，但是明朝又重启了分封制，以至于导致南明的悲剧发生。朱元璋是布衣天子，他分析宋朝和元朝灭亡的原因都是因为臣强主弱，所以就想着建立藩王制度，重用宗室之人。最初分封的时候藩王还是有地方军权，不过靖康之役过后，朱棣就重新开始限制藩王的权利，剥夺了藩王干涉政治、军事、经济的权利。由于藩王的权利被剥夺，以至于南明时期出现了臣子控制藩王的案例。而且藩王世袭制更加加深了明朝宗室之间的矛盾，朱高煦被分配到云南的时候怒道："我何罪？斥万里。"因为藩王封地分配不均以至于藩王之间埋下了矛盾，也是南明政权互相攻击的原因之一。
明朝末期的时候，因为国库空虚外加上天灾的爆发，导致军队和百姓对明朝失去了信心。但是农民起义军讨厌的并不是明朝宗室，而是明朝的大臣。李自成都为崇祯说话，说崇祯是个好皇帝，坏的其实是明朝的大臣。与东晋和南宋都不同，南明是藩王领导百姓。即便党争那么厉害，但是他们仍旧要推一个藩王出来，然后争夺正统。但是藩王太多了，而且藩王和藩王之间的矛盾以及党争的矛盾导致南明的藩王开始互相攻击，以至于被清朝逐个击破。
清朝入关打的旗号就是为崇祯报仇，之后也拉拢明朝的宗室，以便于能更好的统治。藩王们都开始投降清朝了，那么百姓们也都开始接受清朝的统治，藩王之间的世仇让南明不能集中经历对付外敌，而党争更是加剧了藩王之间的矛盾。更要命的是明朝的藩王制度几乎剥夺了藩王的所有权利，以至于南明的藩王多为傀儡，真正掌权的还是大臣和将军。
