因此，在整个明朝时期，对于这位开国老祖宗的保护，是极其周到而且严格，也确实是没有人敢打他的主意
清朝入关后，为了笼络汉人，对明十三陵以及朱元璋的孝陵都实行了保护，并且以法律的形式明确规定，凡有盗皇陵者，杀无赦。不管清朝是处于真心还是假意，总之朱元璋的孝陵是再一次有人保护了。
当年多尔衮的弟弟多铎带领大军南下的时候，看到明孝陵已经破败，就迁入了40户陵户，负责日常的维护。康熙皇帝巡游江南的时候，曾经亲自到明孝陵进行祭拜，还写下了"治隆唐宋"的匾额。
而且，有清一代，反清复明的运动就没有停止过，虽然满清用暴力征服了汉民，让他们剃发易服，但是在普通老百姓心中，大明才是正统，因此，对于朱元璋这位大明朝的开国皇帝，还都是怀有敬意的。
即便是哪个摸金校尉有这个能力，他也得掂量掂量后果，如果真的干了，那就是全民公敌。洪秀全攻占南京后，他也没敢去动明孝陵，而且还恭恭敬敬的去祭拜。1912年民国建立后，孙中山做的第一件事也是带领百官去祭拜明孝陵，
