人们最开始将怀疑的目光对准了当年主张"戊戌变法"的那批人,也就是后来的"保皇党",因为是慈禧的原因才使戊戌变法不幸夭折,保皇党无法对抗慈禧,自然会迁怒于慈禧的心腹李莲英,然而史学家们深究之下却发现保皇党动手的可能性不大。
因为李莲英为人十分圆滑,慈禧和光绪都十分宠爱他,光绪帝更是叫他"谙达"(师傅),还夸他"忠心事主",而他对维新变法也持中立态度,没有坚定的站在慈禧一边,慈溪因为此事还曾责罚于他, 所以保皇党并不仇视李莲英,没有理由对其下手!
也有人怀疑是贼人觊觎李莲英的财物,才暗中下手,将其杀害,但这种说法也有点说不通,就算是谋财害命,也没必要将李莲英斩首啊,还有李莲英明明是死于非命,他的亲属为什么要宣称他是死于痢疾呢?难道杀害李莲英的就是那些作证的亲属?还是那些亲属碍于某些人的权势不敢说出真相呢?
以上种种皆是后人猜测,如今时隔已久,恐怕李莲英的死因将成为一个"千古之谜",永远尘封在历史中!