在对内问题上，隆庆帝也不遗余力，不但严格要求自己，也给万历帝留下一个良好的政治班底。
在隆庆刚登基的时候，国库存银只有二百多万两，而国家的支出却不止这些，国家这时就是处于入不敷出的状态。隆庆便下令"开源节流"，宫内有的物品停止采办，号召勤俭持家，这种行为明显与只知道练丹药的嘉靖帝不知强了多少倍。
在整顿吏治方面，为在嘉靖朝期间直言进谏却获罪的官员平反，以"存者召用，没者恤录"为原则，进行平反活动，其中明朝著名清官海瑞就被官复原职。
除此之外，隆庆帝重用徐阶、李春芳、郭朴、高拱、陈以勤、张居正六位内阁大臣，尤其是张居正，更是"治世之能臣"，在张居正的治理下，给万历留下一个大好河山。
所以，我们看到的是一个几乎没有什么作为的隆庆帝，没有抗击倭寇的战绩，没有北征蒙古的气魄，但是我们并不能因此忽视隆庆帝的作用，真正的能人是把危机扼杀在摇篮里面！没有大事，恰恰说明他做了很多事，防止产生大事！
