纳希切万的地理位置非常独特，它不仅处于东欧与西亚的十字路口，也是俄罗斯人通向伊斯兰世界的重要关卡。所以在历史上纳希切万这块土地，一直就是兵家必争之地。
纳希切万在《圣经》中也有着十分独特的地位，《圣经》说大洪水之后，诺亚建造的第一个城市就位于这里。
在有准确的历史记载中，纳希切万在公元前曾经是亚历山大大帝的马其顿帝国的一部分，后来又被亚美尼亚王国的阿尔沙克王朝所统治。也曾被波斯人、阿拉伯人所统治过……13世纪这片土地被西侵的蒙古大军征服，属于蒙古帝国四大汗国之一的伊尔汗国的土地。
16世纪时，纳希切万被波斯的萨非王朝占领。到了近代19世纪，沙俄与波斯萨非王朝打了一战，俄国人打赢了，于是纳希切万被割让给俄国。就在这以后，大量的亚美尼亚人迁入这里，与当地的阿塞拜疆人产生了较大的民族和宗教矛盾。
