那一年，文彦博已80岁高龄。一个人到了这样的年龄，精力远不如前，别说参与商议、处理军国大事，就算每天上班，都是一件很吃力的事情。高太后为了体恤老臣，允许文彦博6天上一次班，去朝廷觐见皇帝。另外一个月两次来朝廷，给皇帝讲授经学。这样一来，文彦博又拥有了"帝师"的尊称。
1090年，文彦博因年老力衰，再次宣告退休。1097年，文彦博病逝，享年92岁。在人均寿命只有四五十岁的北宋，92岁堪称是长寿老人了。
文彦博去世时，正是新党章惇执政之际，文彦博被视为司马光一派，属于打击对象，因而没有得到谥号，只是在宋徽宗时追加了一个"忠烈"谥号。
