扩廓帖木儿大怒，叹道"：我奉诏总领天下之兵，然而镇将却不受节制，我怎么去讨伐贼寇呢？"于是他率领大军往西入关，进攻李思齐。
李思齐等人会师长安，相互结盟，合力抵抗扩廓帖木儿。史书上记载两军相持一年，交战数百次，但是却不分胜负。
元顺帝得知后，下令扩廓罢兵，要求他领兵攻打江、淮贼寇。扩廓帖木儿却不听调令，继续引军向东，并派骁将貊高直趋河中，想要直捣凤翔，倾覆李思齐的巢穴。哪知貊高的部众突然叛变，胁持貊高叛离扩廓帖木儿，并向朝廷揭发他的罪状。
当初，扩廓帖木儿率兵护卫太子回大都，太子本想胁迫元顺帝禅位，但是扩廓帖木儿不同意，于是太子暗中一直怀恨在心。然后现在扩廓帖木儿不听朝廷调令，群臣纷纷指责他，顺帝也开始疑心他，再加上貊高在奏章上揭发扩廓帖木儿的罪行，元顺帝终于忍不住了，下令剥夺他的官职，让太子总领天下兵马。
