缺点也是有的。一旦爆发了大规模起义，就遭不住了。之前最危险的不外乎三藩之乱，好歹坚持下来了；其他的什么天地会什么老少边穷地区搞事都是小场面，能撑得住。但太平天国起义太大了，南方的满城都被收割得干干净净，这就破坏了满清统治的基本盘。
太平军杀的驻防八旗几乎损失一代人，所以才有课本的那句话，"太平天国运动沉重打击了封建统治阶级，强烈震撼了清政府的统治根基"。就是说南方的旗人被杀得差不多了，从此清朝逐渐失去了对南方诸省乃至全国的控制。动摇了深刻满清的统治。以后清政府对南方的统治都是通过汉族地主间接实现的。
没有太平天国，近代革命也不会在南方搞得轰轰烈烈，这都是站在前人流血牺牲的基础上获得的胜利。
