门阀士族当然不会坐视科举制取代九品中正制，但他们却无可奈何，因为想要实行科举制的，不仅是庶族地主，还有皇帝。九品中正制实际上将选官权力给予了门阀士族，进入朝堂上的官员，不是世家子弟，就是依附于世家的寒门子弟。故而，在魏晋南北朝时期，权臣篡逆谋反频出，朝代不断更迭。这对于皇帝来说，显然是无法接受的。魏晋南北朝时期的皇帝想要限制世族的权力，但他们离不开世族的支持，因而无从下手。隋唐以后，庶族地主阶级不断崛起，他们要求政治权利，而这正合皇帝的心意。所以，与其说科举制的实行是皇帝向庶族地主的妥协，不如说是他们的联合。实行科举制，皇帝便可以将选官权利从世族手中夺走，这有利于中央集权和皇权的加强。
除此以外，隋唐可以用科举制取代九品中正制，还有一个条件，那就是它们都是大一统的王朝。魏晋南北朝时期天下大乱，诸侯林立，皇帝必须依附于世家大族。西晋灭亡以后，司马氏东渡建立东晋，依靠的就是名门望族，故而他们即使不满世族掌权，也无可奈何，毕竟世族可以立他们，亦可以废他们。可是隋唐不同，隋朝和唐朝都是大一统的王朝，中央集权和皇权的集中程度远非魏晋可比。
唐朝建立以后，借鉴隋朝灭亡的教训，不与世族正面发生冲突，而是潜移默化的削弱世族的力量。比如唐朝孔颖达校订五经，朝廷在全国颁布《五经正义》，发展教育，打破了门阀士族对于文化的垄断。这为科举制的实行和发展，提供了文化基础和社会环境。
其实，门阀士族的诞生本就是基于乱世和各种因素，他们对于政治、经济、文化的垄断，无疑是对皇权的挑战和对其他阶级权益的限制。隋唐以后，不论是皇帝还是庶族地主阶级，亦或是普通百姓，他们都要求建立新的选官制度，以打破门阀士族的垄断地位。因此，科举制才会取代九品中正制，成为中国古代最重要的选官制度。
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