清朝道光年间，在江苏苏州周庄镇的东颖村，出土了一块墓志铭，这是明初昆山人卢充撰写的《故沈伯熙（沈万三之孙）墓志》：沈伯熙死于洪武十九年（1386年），寿命40岁。
元末明初人王行，两次受聘为沈氏家庭教师，但与沈万三仅见过一面，他撰写过沈万三两个儿子《沈荣甫墓志铭》、《沈茂卿墓志铭》：1376，沈万三之子沈荣甫死，享年71岁，沈森（沈荣甫之子）与父亲死于同年，享年48。其中有一句话极为重要："初，(沈)荣甫之先君子（沈万三）"，所谓"先君子"，就是去世之人，可见王行为沈荣甫撰写墓志铭时，沈万三已经去世，否则不会用"先君子"来说明。
通过这三个墓志记载，虽然无法得知明朝建立时，沈万三到底有没有死，但却可以推测出沈万三的年龄应该80岁上下，否则不可能有50余岁的侄子沈汉杰、60多岁的儿子、40多岁的孙子。
《明史》记载，明军平定云南的1382年，朱元璋将沈万三抄家发配云南。1381年，朱元璋才正式对云南用兵，次年平定该地，云南正式纳入朱元璋的版图。这一记载就让人难以理解了，明朝建立到1382年，已经过去了14年，这时沈万三应该有90多岁，宣称以孝治国的朱元璋，将一个几乎百岁的老人发配云南？怎么看都不合逻辑！
